- رئیس پژوهشگاه (محمد حسنزاده)
- دفتر ریاست (رئیس: ناهید محمودیان)
- مدیریت ارزیابی و تحول اداری (مدیر: احمد گنجی)
- گروه خدمات دانشبنیان (رئیس: پریسا لامعی میرکوهی)
- اداره روابط عمومی (رئیس: نورالله رزمی)
- اداره حراست
- مرکز فناوری اطلاعات و امنیت فضای مجازی (رئیس: نصراله پاکنیت)
- گروه برنامهریزی و طراحی فناوری اطلاعات (رئیس: نزهت مصفا)
- اداره سامانههای اطلاعاتی (رئیس: علیاصغر حجتپناه)
- اداره زیرساختهای اطلاعاتی (رئیس: علیرضا کبودان)
- اداره راهبری و پایش امنیت فناوری اطلاعات و فضای مجازی
- گروه پشتیبانی سامانههای اطلاعاتی (رئیس: نساء رضائی)
- معاونت پژوهش و آموزش (معاون: محمدجواد ارشادی)
- مدیریت امور پژوهش (مدیر: زهرا عقبایی)
- مدیریت آموزش (مدیر: علیرضا ثقهالاسلامی)
- گروه ارتباطات علمی (رئیس: الهام علایی ابوذر)
- کتابخانه
- معاونت اطلاعات علم و فناوری ایران (معاون: فریبرز درودی)
- مدیریت ثبت و فراهمآوری اطلاعات (مدیر: مهدی محمودیان)
- مدیریت سازماندهی و تحلیل اطلاعات (مدیر: طاهره صادقیان خشویی)
- اداره حفظ و اشاعه اطلاعات (رئیس: ابراهیم معز)
- گروه اشتراک منابع (رئیس: حمیده بیرامیطارونی)
- معاونت اداری و مالی (معاون: حنیف حیدری)
- مدیریت مالی (مدیر: مریم قربانی)
- مدیریت اداری و پشتیبانی (مدیر: لیلا کاظمی)
- اداره بودجه (رئیس: سارا یوسفی)
- پژوهشکده فناوری اطلاعات (رئیس: امیرحسین صدیقی)
- گروه پژوهشی مدیریت فناوری اطلاعات
- گروه پژوهشی سیستمهای اطلاعاتی
- گروه پژوهشی کسبوکار الکترونیک
- پژوهشکده علوم اطلاعات (رئیس: سید مهدی سمائی)
- گروه پژوهشی اصطلاحشناسی و هستانشناسی
- گروه پژوهشی زبانشناسی رایانشی
- گروه پژوهشی علمسنجی و تحلیل اطلاعات
- پژوهشکده جامعه و اطلاعات (رئیس: رحمان شریفزاده)
- گروه پژوهشی سیاست اطلاعات
- گروه پژوهشی اخلاق و حقوق اطلاعات
- گروه پژوهشی مطالعات اجتماعی اطلاعات
- اعضای حقوقی
- دکتر حسین سیمایی صراف (وزیر عتف و رئیس هیئت امنا)
- دکتر علی خاکیصدیق (قائم مقام وزیر و رئیس مرکز هیئتهای امنا و هیئتهای ممیزه)
- دکتر سید مهدی ابطحی فروشانی (معاون پژوهش و فناوری وزارت عتف و رئیس کمیسیون دائمی)
- دکتر علی خورسندی طاسکوه (سرپرست مؤسسه پژوهش و برنامهریزی آموزش عالی و دبیر هیئت امنا)
- دکتر سیدسروش قاضینوری نائینی (رئیس موسسه تحقیقات سیاست علمی کشور)
- دکتر رسول صادقی (سرپرست مؤسسه تحقیقات جمعیت کشور)
- دکتر فریبا محمدی (سرپرست پژوهشگاه تربیت بدنی و علوم ورزشی)
- دکتر امیرعلی سیفالدین اصل (نماینده سازمان برنامه و بودجه کشور)
- دکتر محمد حسنزاده (رئیس ایرانداک)
- اعضای حقیقی
- دکتر مهدی پندار (معاون اداری، مالی، و مدیریت منابع وزارت عتف)
- دکتر سید احمدرضا خضری
- دکتر حسین میرزایی
- دکتر محمدرضا اصلاحچی
- دکتر رحمت ستوده قرهباغ
رئیسان پیشین
1392 - 1401 دکتر سیروس علیدوستی
1386 - 1392 دکتر سیدامید فاطمی
1371 - 1386 دکتر حسین غریبی
1368 - 1371 علی آجیلفروش
1360 - 1368 محمدنقی مهدوی
1360 عبدالحسین آذرنگ
1359 شهین نعمتزاده
1359 شورای سرپرستی (دکتر احمد میرزاده، علی آقابخشی، و عباس اسلامیه)
1358 - 1359 عبدالحسین آذرنگ
1355 - 1357 دکتر علیاکبر بیهقی
1348 - 1355 علی سینایی
